زایشگاه بیمارستان آیت الله مدنی بجستان پس از اجرای طرح هتلینگ بیمارستان در سال 1395 دارای یک اتاق معاینه که شامل تخت ژنیکولوژی و تخت معاینه می‌باشد و همچنین دو اتاق LDR که هر کدام به طور جداگانه شامل تخت ژنیکولوژی و تخت بستری و تخت نوزاد و وارمر می‌باشد که هر اتاق دارای سرویس بهداشتی و حمام است؛ که یکی از اتاق های LDR دارای تخت احیای نوزاد می باشد.

کلیه بیماران مراجعه کننده به بخش زایشگاه توسط متخصص زنان و زایمان و یا ماماهای بخش ویزیت و معاینه می‌شوند و با توجه به شرایط بیمار، سن بارداری، کم خطر بودن یا پرخطر بودن، داشتن شرایط زایمان فیزیولوژیک و... تحت مراقبت های لازم قرار می گیرند.

گزیده ای از وظایف بخش شامل: پذیرش مادران باردار از اوایل حاملگی تا زمان زایمان و 6 هفته بعد از زایمان، انجام مراقبت های درمانی مربوط به زایمان و مراقبت‌های پس از زایمان، مراقبت از نوزاد بعد تولد، شیردهی نوزاد، انجام نوار قلب جنین، پیگیری مادران پرخطر و... می باشد.